Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms