Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spocd1B1ASB6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms