Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms