Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms