Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr16A3KMN5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms