Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2A3KGV1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms