Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rtf1A2AQ19 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtf1A2AQ19 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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