Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CtcflA2APF3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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