Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms