Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramel3A2AHA7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms