Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19bA2A7Q9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19bA2A7Q9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms