Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms