Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms