Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms