Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms