Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsjQ9R014 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms