Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms