Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf4Q9QZS2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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