Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms