Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf11Q9QYK7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf11Q9QYK7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf11Q9QYK7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf11Q9QYK7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf11Q9QYK7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf11Q9QYK7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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