Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh11Q9QYF1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms