Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tomm40Q9QYA2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms