Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms