Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nphp1Q9QY53 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms