Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Snai3Q9QY31 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms