Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ChmQ9QXG2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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