Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd1Q9QXD8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms