Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpc5Q9QX29 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpc5Q9QX29 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms