Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chaf1aQ9QWF0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms