Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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