Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms