Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm1Q9JLF6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgm1Q9JLF6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms