Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CubnQ9JLB4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms