Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg3Q9JL95 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Prg3Q9JL95 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg3Q9JL95 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms