Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Chrac1Q9JKP8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chrac1Q9JKP8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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