Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mrpl39Q9JKF7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mrpl39Q9JKF7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mrpl39Q9JKF7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Mrpl39Q9JKF7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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