Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms