Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms