Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smco4Q9JIS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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