Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SelenofQ9ERR7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SelenofQ9ERR7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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