Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnft1Q9DCN7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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