Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Smg9Q9DB90 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smg9Q9DB90 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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