Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim23Q9DAL0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms