Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco2Q9DA21 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms