Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms