Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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