Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms