Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9D727 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q9D727 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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