Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lonrf3Q9D4H7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lonrf3Q9D4H7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lonrf3Q9D4H7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lonrf3Q9D4H7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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