Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms